医院创建于1960年,原名“浙江省建工医院”。2003年成建制划转至浙江中医药大学,更名“浙江省新华医院”,成为其直属附属医院。2006年更名为“浙江中医药大学附属第二医院、第二临床医学院”。医院总建筑面积6万余平方米,核定床位1200张,年门诊量80余万人次,年出院量超过2.5万人次。医院先后被评选为全国卫生系统先进集体、浙江省中医“名院”、浙江省健康促进医院。医院牵头组建国家(浙江省)中医应急救治医疗队,并入选全国首批中医药传承创新工程重点中医医院建设备选项目,获批国家中医临床研究基地建设单位。